Я активно использую Git и GitHub для разработки, вот пример репозитория: https://github.com/Open-GTO/Open-GTO
Там две ветки, одна - master, в которой разрабатывается последняя версия и вторая - v1.1, в которой поддерживается стабильная. То есть Git мне позволяет выпускать исправления для старой версии, параллельно разрабатывая новую. Плюс к этому, я могу вернуться в любую точку в прошлом, с момента начала использования CVS (изначально я использовал SVN), могу вернуться в 2010 и посмотреть то, как всё выглядело в то время. Удобств масса, нужно лишь немного изучить Git.
Проблем со слиянием при написании всего проекта в один файл быть не должно, у Git очень умная система слияний. Но посмотреть свой файлик через web-интефрейс одного из хостинга исходных кодов вряд ли получится, обычно размеры ограничены.
Для приватных репозиториев используй Bitbucket или GitLab, там они бесплатны (по крайней мере некоторое количество).
На счёт Git клиентов. При разработке я обычно использую обычный git, то есть работаю через терминальную сессию, но я использую ОС на базе Linux, а на них очень много удобных терминалов. А вот для Windows их не завезли, приходится страдать. Хотя для простых задач (создание коммита) достаточно простенького GitHub Desktop, но это очень ограниченный клиент и кроме коммитов он ничего не умеет. Поэтому я советую использовать Git через PowerShell, но, если на текстовый интерфейс аллергия, то можно попробовать что-то вроде TortoiseGit, я её не видел, но их SVN клиент был хорошим.
Советую прочитать эту статью, в ней описано то, как следует организовывать свой репозиторий и работать с ним. Я не следую этой модели из-за лени, но к этому определённо нужно стремиться.